MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	ATTT	3	12	844	855	25 %	75 %	0 %	0 %	203288437
2	NC_011260	TAA	2	6	868	873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288437
3	NC_011260	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288437
4	NC_011260	TAATTT	2	12	919	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
5	NC_011260	TTA	2	6	1028	1033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
6	NC_011260	TAG	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288437
7	NC_011260	CTT	2	6	1118	1123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288437
8	NC_011260	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
9	NC_011260	TAT	2	6	1158	1163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
10	NC_011260	CTA	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
11	NC_011260	TTC	2	6	1180	1185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288437
12	NC_011260	T	6	6	1200	1205	0 %	100 %	0 %	0 %	203288437
13	NC_011260	ATC	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
14	NC_011260	TAC	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
15	NC_011260	CAT	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
16	NC_011260	TA	3	6	4157	4162	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
17	NC_011260	TTTA	2	8	4164	4171	25 %	75 %	0 %	0 %	203288438
18	NC_011260	TTTA	2	8	4191	4198	25 %	75 %	0 %	0 %	203288438
19	NC_011260	TATTT	2	10	4233	4242	20 %	80 %	0 %	0 %	203288438
20	NC_011260	GTT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288438
21	NC_011260	AAT	2	6	4273	4278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288438
22	NC_011260	GAA	2	6	4303	4308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288438
23	NC_011260	A	7	7	4314	4320	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
24	NC_011260	A	6	6	4378	4383	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
25	NC_011260	AT	3	6	4415	4420	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
26	NC_011260	ATA	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288438
27	NC_011260	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
28	NC_011260	TGG	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288438
29	NC_011260	A	8	8	4504	4511	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
30	NC_011260	TAA	2	6	4605	4610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288438
31	NC_011260	AT	3	6	4625	4630	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
32	NC_011260	CAAA	2	8	4957	4964	75 %	0 %	0 %	25 %	203288439
33	NC_011260	ATTA	2	8	5054	5061	50 %	50 %	0 %	0 %	203288439
34	NC_011260	CAAA	2	8	5066	5073	75 %	0 %	0 %	25 %	203288439
35	NC_011260	T	6	6	5092	5097	0 %	100 %	0 %	0 %	203288439
36	NC_011260	GAT	2	6	5108	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288439
37	NC_011260	AAC	2	6	5122	5127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288439
38	NC_011260	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288439
39	NC_011260	A	6	6	5181	5186	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
40	NC_011260	TA	3	6	5219	5224	50 %	50 %	0 %	0 %	203288439
41	NC_011260	TAA	2	6	5236	5241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288439
42	NC_011260	AAC	2	6	5252	5257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288439
43	NC_011260	TTA	2	6	5267	5272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288439
44	NC_011260	ATG	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288439
45	NC_011260	AT	3	6	5312	5317	50 %	50 %	0 %	0 %	203288439
46	NC_011260	A	8	8	5337	5344	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
47	NC_011260	ACAAA	2	10	5350	5359	80 %	0 %	0 %	20 %	203288439
48	NC_011260	A	6	6	5357	5362	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
49	NC_011260	GTCA	2	8	5399	5406	25 %	25 %	25 %	25 %	203288439
50	NC_011260	TAT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288439
51	NC_011260	ATA	2	6	5415	5420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288439
52	NC_011260	A	6	6	5420	5425	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
53	NC_011260	A	7	7	5442	5448	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
54	NC_011260	AGA	2	6	5512	5517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288439
55	NC_011260	AAATAA	2	12	5518	5529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288439
56	NC_011260	A	7	7	5528	5534	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
57	NC_011260	AG	3	6	5542	5547	50 %	0 %	50 %	0 %	203288439
58	NC_011260	A	6	6	5560	5565	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
59	NC_011260	TTA	2	6	5608	5613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288439
60	NC_011260	CAA	2	6	5691	5696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288440
61	NC_011260	ATAAAA	2	12	5697	5708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288440
62	NC_011260	A	8	8	5705	5712	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
63	NC_011260	TTA	2	6	5721	5726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288440
64	NC_011260	ATAA	2	8	5738	5745	75 %	25 %	0 %	0 %	203288440
65	NC_011260	A	6	6	5801	5806	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
66	NC_011260	A	7	7	5808	5814	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
67	NC_011260	GA	3	6	5833	5838	50 %	0 %	50 %	0 %	203288440
68	NC_011260	ATTT	2	8	5871	5878	25 %	75 %	0 %	0 %	203288440
69	NC_011260	TAT	2	6	5912	5917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288440
70	NC_011260	AAT	2	6	5941	5946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288440
71	NC_011260	ATG	2	6	5961	5966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288440
72	NC_011260	TA	3	6	6047	6052	50 %	50 %	0 %	0 %	203288440
73	NC_011260	A	7	7	6073	6079	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
74	NC_011260	A	10	10	6081	6090	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
75	NC_011260	A	8	8	6135	6142	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
76	NC_011260	G	6	6	6175	6180	0 %	0 %	100 %	0 %	203288440
77	NC_011260	GTA	2	6	6185	6190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288440
78	NC_011260	A	7	7	6201	6207	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
79	NC_011260	AAT	2	6	6213	6218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288440
80	NC_011260	GTG	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288441
81	NC_011260	T	7	7	6268	6274	0 %	100 %	0 %	0 %	203288441
82	NC_011260	ATTG	2	8	6309	6316	25 %	50 %	25 %	0 %	203288441
83	NC_011260	T	6	6	6348	6353	0 %	100 %	0 %	0 %	203288441
84	NC_011260	ATTGCA	2	12	6354	6365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288441
85	NC_011260	AT	3	6	6423	6428	50 %	50 %	0 %	0 %	203288441
86	NC_011260	ATGA	2	8	6448	6455	50 %	25 %	25 %	0 %	203288441
87	NC_011260	TA	3	6	6571	6576	50 %	50 %	0 %	0 %	203288441
88	NC_011260	ATA	3	9	6574	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
89	NC_011260	AAT	2	6	6613	6618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
90	NC_011260	ATT	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288441
91	NC_011260	TAA	2	6	6689	6694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
92	NC_011260	A	7	7	6705	6711	100 %	0 %	0 %	0 %	203288441
93	NC_011260	AG	3	6	6759	6764	50 %	0 %	50 %	0 %	203288441
94	NC_011260	ATA	2	6	6784	6789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
95	NC_011260	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288441
96	NC_011260	GAT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288441
97	NC_011260	T	6	6	6863	6868	0 %	100 %	0 %	0 %	203288441
98	NC_011260	TTTG	2	8	6881	6888	0 %	75 %	25 %	0 %	203288441
99	NC_011260	ATT	2	6	6896	6901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288441
100	NC_011260	AAT	2	6	6925	6930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
101	NC_011260	TAAAAA	2	12	6993	7004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288442
102	NC_011260	GAT	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288442
103	NC_011260	TTTG	2	8	7047	7054	0 %	75 %	25 %	0 %	203288442
104	NC_011260	GTA	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288442
105	NC_011260	GAT	2	6	7126	7131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288442
106	NC_011260	TAA	2	6	7137	7142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288442
107	NC_011260	TA	4	8	7187	7194	50 %	50 %	0 %	0 %	203288442
108	NC_011260	AT	3	6	7263	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	203288442
109	NC_011260	TAT	2	6	7296	7301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288442
110	NC_011260	AAT	2	6	7321	7326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288442
111	NC_011260	A	7	7	7344	7350	100 %	0 %	0 %	0 %	203288442
112	NC_011260	A	7	7	7371	7377	100 %	0 %	0 %	0 %	203288442
113	NC_011260	AG	3	6	7445	7450	50 %	0 %	50 %	0 %	203288442
114	NC_011260	ATA	2	6	7493	7498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288442
115	NC_011260	A	6	6	7522	7527	100 %	0 %	0 %	0 %	203288442
116	NC_011260	GGA	3	9	8276	8284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288443
117	NC_011260	AGGA	2	8	8289	8296	50 %	0 %	50 %	0 %	203288443
118	NC_011260	AAGG	2	8	8311	8318	50 %	0 %	50 %	0 %	203288443
119	NC_011260	GTA	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
120	NC_011260	TGA	2	6	8422	8427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
121	NC_011260	GAAA	2	8	8445	8452	75 %	0 %	25 %	0 %	203288443
122	NC_011260	TGA	2	6	8476	8481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
123	NC_011260	TGG	2	6	8482	8487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288443
124	NC_011260	CAG	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288443
125	NC_011260	GTATA	2	10	8515	8524	40 %	40 %	20 %	0 %	203288443
126	NC_011260	AAC	2	6	8559	8564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288443
127	NC_011260	A	6	6	8666	8671	100 %	0 %	0 %	0 %	203288443
128	NC_011260	TGA	2	6	8680	8685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
129	NC_011260	A	7	7	8692	8698	100 %	0 %	0 %	0 %	203288443
130	NC_011260	TTG	2	6	8745	8750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288443
131	NC_011260	TGA	2	6	8767	8772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
132	NC_011260	GTT	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288443
133	NC_011260	AGTAGC	2	12	8791	8802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203288443
134	NC_011260	TCT	2	6	8828	8833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288443
135	NC_011260	AAT	2	6	8834	8839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288443
136	NC_011260	TAA	2	6	10538	10543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288444
137	NC_011260	TAA	2	6	10561	10566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288444
138	NC_011260	TATC	2	8	10624	10631	25 %	50 %	0 %	25 %	203288444
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263	NC_011260	AT	3	6	20268	20273	50 %	50 %	0 %	0 %	203288450
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265	NC_011260	TAT	2	6	20352	20357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288450
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269	NC_011260	T	6	6	20504	20509	0 %	100 %	0 %	0 %	203288450
270	NC_011260	TAT	2	6	20544	20549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288450
271	NC_011260	TGTT	2	8	20550	20557	0 %	75 %	25 %	0 %	203288450
272	NC_011260	TCA	2	6	20570	20575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288450
273	NC_011260	CTC	2	6	20598	20603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288450
274	NC_011260	ATCT	2	8	20650	20657	25 %	50 %	0 %	25 %	203288450
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278	NC_011260	TTCT	2	8	20764	20771	0 %	75 %	0 %	25 %	203288450
279	NC_011260	ATT	2	6	21294	21299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288451
280	NC_011260	TAC	2	6	21360	21365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288451
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283	NC_011260	CTT	2	6	21566	21571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288451
284	NC_011260	T	6	6	21578	21583	0 %	100 %	0 %	0 %	203288451
285	NC_011260	TTG	2	6	21594	21599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288451
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290	NC_011260	TAA	2	6	24202	24207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288452
291	NC_011260	TA	3	6	24209	24214	50 %	50 %	0 %	0 %	203288452
292	NC_011260	TA	3	6	24233	24238	50 %	50 %	0 %	0 %	203288452
293	NC_011260	TGA	2	6	24313	24318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288452
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295	NC_011260	ATA	2	6	24507	24512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288452
296	NC_011260	ATA	2	6	24594	24599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288452
297	NC_011260	AGAT	2	8	24600	24607	50 %	25 %	25 %	0 %	203288452
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302	NC_011260	TC	3	6	28829	28834	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
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382	NC_011260	AT	3	6	33949	33954	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
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